“秒速五厘米”的含义是“只要去追求就一定会成功，不追求一定会失败。”
新海诚的作品有一个非常明显的设定，即：“只要去追求就一定会成功。”这个设定从《秒速五厘米》开始，一直贯彻到《言叶之庭》以及《你的名字》，主角的失败大多数情况下不是因为其他原因，而是因为自己的选择。
同样的，主角之所以成功也不是因为其他原因，而是因为自己的选择。如迟到了五个小时的贵树坚持走到了最后，而明里还在车站里等他，实际上那时候的贵树已经不抱希望了，但他依旧选择坐到终点。
使是在最终迟到了五个小时的情况下，他依旧达到了自己的目的，两个人最终还是见上面了，而这也是贵树在整集故事里唯一一次做出“选择”的时刻。
《秒速5厘米》寓意：有点戏弄和讽刺初恋的感觉所表达的爱是羞涩初恋的爱这种爱是朦胧的。两人之间对初恋的理解却各有不同。
明理是把初恋当做一个美好的回忆，而贵树却是恋恋不忘还伴随着悔恨和痛苦而且伤及身边的人。
感觉不要见面最好如果得知明理要结婚新郎不是我。这种感觉估计他自杀的心都会有。因为他无法把感情处理的那么好他爱的人和爱他的人都被他伤及到了。这种伤是一辈子的痛伤。
表达是对爱这种感觉应该妥善处理，对于初恋的爱只要当做一种回忆就好。
不要因为明明知道无法再见却难以忘怀，导致爱你的人与你相别。不仅让自己痛苦也让他人受到同样的痛苦。