第一部是：《计时引爆摩天楼》天才建筑师给工藤新一写了信让他过来解决爆炸案子，森谷帝二为了报复当初工藤新一解决了市长的案子导致他的建筑耽搁了。
第二部是：《第14个目标》毛利小五郎十几年前抓的犯人已经出狱了，而他身边的人接二连三遭到暗杀。
《世纪末魔术师》、《瞳孔中的暗杀者》、《通往天国的倒计时》、《贝克街的亡灵》、《迷宫的十字路》、《银翼的魔术师》
以下为名侦探柯南全部的剧场版
《水平线上的阴谋》、《侦探们的镇魂歌》、《绀碧之棺》、《战栗的乐谱》、《漆黑的追踪者》、《天空的遇难船》、《沉默的15分钟》、《第11个前锋》、《绝海的侦探》、《异次元的狙击手》、《业火的向日葵》、《纯黑的噩梦》、《唐红的恋歌》、《零的执行人》、《绀青之拳》、《绯色的弹丸》
（一）1997年——《名侦探柯南剧场版》之计时引爆摩天楼
（二）1998年——《名侦探柯南剧场版》之第十四个目标
（三）1999年——《名侦探柯南剧场版》之世纪末的魔术师
（四）2000年——《名侦探柯南剧场版》之瞳孔中的暗杀者
（五）2001年——《名侦探柯南剧场版》之通往天国的倒计时
（六）2002年——《名侦探柯南剧场版》之贝克街的亡灵
（七）2003年——《名侦探柯南剧场版》之迷宫的十字路
（八）2004年——《名侦探柯南剧场版》之银翼的魔术师
（九）2005年——《名侦探柯南剧场版》之水平线上的阴谋
（十）2006年——《名侦探柯南剧场版》之侦探们的镇魂歌
（十一）2007年——《名侦探柯南剧场版》之绀碧之棺蔚蓝色的灵柩
（十二）2008年——《名侦探柯南剧场版》之战栗的乐谱
（十三）2009年——《名侦探柯南剧场版》之漆黑的追踪者
（十四）2010年——《名侦探柯南剧场版》之天空的遇难船
（十五）2011年——《名侦探柯南剧场版》之沉默的15分钟
（十六）2012年——《名侦探柯南剧场版》第11个前锋第11名王牌
（十七）2013年——《名侦探柯南剧场版》绝海的侦探
（十八）2014年——《名侦探柯南剧场版》异元次的狙击手
第一部剧场版《计时引爆摩天楼》
第二部剧场版《第十四个目标》
第三部剧场版《世纪末的魔术师》
第四部剧场版《瞳孔中的暗杀者》
第五部剧场版《通往天国的倒计时》
第六部剧场版《贝克街的亡灵》
第七部剧场版《迷宫的十字路》
第八部剧场版《银翼的魔术师》